Bažnyčia pastatyta 1872 m. Prabėgus dvidešimt septyneriems metams ją konsekravo vyskupas Antanas Baranauskas. Bažnyčia dvibokštė, su žemesne stačiakampe apside ir prie jos esančiomis zakristijomis, trimis altoriais. Šventoriaus tvora medinių statinių, su mūriniais stulpais. Krokialaukio Atsimainymo bažnyčios altoriai ir varpas yra įtraukti į Nekilnojamųjų kultūros vertybių registrą.
Dėl apsilankymo bažnyčioje ne Mišių metu reikia tartis su klebonu žemiau nurodytu telefono numeriu.